Der Kirchenvorstand (das Direktorium) besteht aus sechs Mitgliedern, die auf der Generalsversammlung der Versöhnungsgemeinde gewählt werden. Außerdem gehören Pastor und Pastorin qua Amt zu diesem Gremium, welches die Gemeinde in allen Fragen leitet.
Aktuell gehören folgende Personen zum Direktorium der Versöhnungsgemeinde:
Edzard zu Knyphausen, Präsident
Andreas Klein, stellv. Präsident
Reinhild Reßmeyer, Schatzmeisterin
Marin Radefeldt, Schriftführerin
Eduardo Rojas, Mitglied
Britta Heise, Mitglied
Pastorin Nicole Oehler
Pastor Johannes Merkel
